โรงเรียนสุเหร่าลำแขก ก่อตั้งเมื่อวันที่ 24 มกราคม 2476 เดิมชื่อโรงเรียนประชาบาลตำบลลำผักชี 3 (สุเหร่าลำแขก) ตั้งอยู่หมู่ที่ 8 ตำบลลำผักชีโดยอาศัยสถานที่ และที่ดินของมัสยิดดารุ่นนาซีฮะห์ (สุเหร่า ลำแขก) ต่อมาเมื่อวันที่ 17 กุมภาพันธ์ 2503 นายทุ่ง เสาธงใหญ่ กรรมการของโรงเรียน ได้อุทิศที่ดินให้กับทางราชการ เพื่อสร้างโรงเรียน จำนวน 2 ไร่ ตั้งอยู่เลขที่ 10/11 หมู่ที่ 9 แขวงลำผักชี เขตหนองจอก กรุงเทพมหานคร 10530 ซึ่งตรงกันข้ามกับทีเดิม ติดกับถนนสุวินทวงค์